Tiago,
  Obrigada!
  Entretanto consegui uma resposta da FCT relativamente a esta questão. A informação que me prestaram é a de que o valor pago pela FCT a título de propina serve também  para pagar esta despesa. O problema é que como a FCT está atrasada nos pagamentos e a  Faculdade exige que seja o Bolseiro a pagar. Foi o que tive que fazer!  

  Sem o pagamento não seria admitida para prestar provas, não poderia entregar a Tese e logo o meu processo enquanto bolseira não ficaria concluído pelo que nem poderia solicitar o pagamento do subsídio para a execução gráfica da Tese.   
 
 
Resta-me saber se, quando a FCT pagar o que deve à Faculdade me reembolsam aquele valor. Mas essa questão terei que resolvê-la junto da Faculdade.  
 
 
Provavelmente nem todas as instituições procedem de igual forma, mesmo dentro da mesma Universidade. De qualquer modo aqui fica a informação para os colegas que sejam confrontados com uma situação semelhante.
 Bom trabalho para todos!  
 
 
  Renata Benavente